skripsi's babbling

judulnya...wekekek..ga kuat..(bener ga ya pronounciation celoteh buat babbling? ) secara saat ini lagi musim sidang skripsi..maka gw mulai menelusuri macam apa skripsi gw dulu yang nyaris terlupakan..3 tahun yang lalu..cepat sekali berlalu..herewith from digilab ui..

============================================================
Skripsi Dep. Teknik Elektro
No. Panggil : R.03.05.97 Ari p
Judul : Prediksi lokasi exon dengan menggunakan hidden Markov model pada gen drosophila melanogaster, homo sapiens serta zea mays
Pengarang : Ariyani, Atik
No. Mahasiswa : 040103706Y
Departemen : Elektro (Program Sarjana)
Tahun : 2005
Desk. Fisik : ix, 73 hlm.il.30 cm. + lamp.
Pembimbing : Gunawan, Dadang
Lokasi : Perpustakaan Fakultas Teknik


Abstrak:
DNA merupakan komponen penting dalam tubuh makhluk hidup dalam kaitannya dengan sintesis asam amino penyusun protein. Informasi mengenai sintesis asam amino tersebut direpresentasikan oleh empat buah karakter nukleotida A, T, C dan G yang mempakan simbol basa-basa nitrogen penyusun DNA. Rangkaian DNA makhluk hidup tersusun atas gen-gen yang panjangnya jutaan bahkan milyaran karakter nukleotida. Namun, yang terpakai sebagai kode genetik dalam sintesis asam amino hanya karakter nukleotida yang terdapat pada suatu daerah pengkodean yang disebut exon dalam setiap gen.

Hidden Markov Model (HMM) merupakan salah satu cara yang dapat digunakan untuk memprediksi lokasi exon pada DNA. HMM memiliki dua buah fase, yakni fase training dan fase tes. Sequence-sequence DNA ditraining untuk mendapatkan estimasi matrik transisi dan estimasi matrik emisi melalui proses iterasi. Matrik transisi dan matrik emisi ini kemudian digunakan untuk mengetes sequence DNA yang bersangkutan.

Pada skripsi ini, simulasi dilakukan dengan menggunakan tiga jenis organisme, Drosophila melanogaster (lalat buah). Homo sapiens (manusia), serta Zea mays (padi). Data yang diperoleh dari simulasi berupa nilai sensitivity (Sn) dan specificity (Sp) hasil prediksi lokasi exon gen yang bersangkutan. Dari perhitungan nilai akurasi untuk Drosophila melanogaster didapat nilai akurasi Sn sebesar 92.5% dan nilai Sp sebesar 88%, pada Homo sapiens dengan nilai akurasi Sn sebesar 69.7% dan nilai Sp sebesar 44.7% serta pada Zea Mays dengan nilai akurasi Sn sebesar 55.6% dan nilai Sp sebesar 78.6%.

===========================================================

Kalo diinget2..ancur juga, kenapa gw bisa milih topik itu..topik yang sama sekali keliatan diluar elektro..elektro bo..masa bahasnya gen..huehehe..wireless gitu kek..atau antena..nyambung gitu lho..lha ini..gen..whats'up? kalo bukan gara2 prof.dr.ir.dadang Gunawan alis pididi, dialah yang menjerumuskan gw ke dunia gen itu..dia yang ssemangat sekali karena menurutnya bioinformatik itu lagi booming dan prospeknya baguss diluar. Yahh, karena pembimbing dah berkata seperti itu..mau diapain lagi..

Omong2 gen..ternyata setelah ditelusuri, ssskripsi adek gw juga mandeg 1,5 tahun gara2 bioinformatik alias gen ini..hahaha..jadinya sekarang dia pindah haluan pembimbing, beralih ke saham.

btw, hidup emng aneh, kerjaan juga aneh, perjalanannya macem2..lepas skripsong dari dunia gen, kecebur di dunia telco banget di adacell, tapi ternyata cuman mulus 1 tahun, kecebur lagi di dunia IP dan internet..(oh maiii..ini kan yang gw hindarin dulu..kuliah2 orang PS Komputer..tapi sekarang malah kecebur). Yah..semoga semakin menguatkan diri ini untuk tidak memusuhi subjek tertentu..karena dah pengalaman, kalau dimusuhin malah ketimpaan ceburannya..

skripsi..seru juga nginget masa2 itu..jadi inget dadang's angels (Farah and Rita) juga mas Roy and also Barkah dan Noviar, dan juga Surya..hehehe..jalannya dah beda masing2 sekarang semuanya..

1 komentar:

Xnu_G said...

Mbak mau nanya dibimbing Prof Dadang Gunawan enak gak? Mau rencana ngambil dia nich. Thanks.